Il Santuario, che sorge sul Passo del Pertuso ad un’altitudine di 650 metri s.m.l., in posizione dominante sulla Val Polcevera, fu costruito, dapprima come semplice cappella e ampliato nei secoli, come ringraziamento per la vittoria del 1625 delle truppe genovesi, affiancate da un gruppo di volontari polceveraschi guidati dal parroco di Montanesi, sui franco – savoiardi.
Nel 1637 il governo della Repubblica di Genova donò al santuario una pala d’altare raffigurante la vergine in trono tra i Santi protettori della Repubblica. Oggi, sull’altare maggiore, si trova una statua raffigurante la Madonna col Bambino, che ha in mano la bandiera della Repubblica di Genova.
Sul piazzale antistante sono posti numerosi e significativi ex voto e cimeli delle due guerre mondiali, tra cui un obice austriaco della Prima Guerra Mondiale, donato al santuario dal generale Diaz nel 1919.